MALDI-TOF MS技术快速区分携带rmpA2毒力基因的高毒力肺炎克雷伯菌

摘要：

目的 评价基质辅助激光解析/电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)技术快速区分携带rmpA2毒力基因的高毒力肺炎克雷伯菌的能力.方法 对浙江大学医学院附属第二医院和河南省人民医院的57株肺炎克雷伯菌,PCR扩增rmpA2毒力基因和荚膜血清型基因,多位点序列分型方法(MLST)进行分型,拉丝试验进行高黏液表型测定.MALDI-TOF MS对肺炎克雷伯菌进行鉴定并对峰图进行二维分析和算法统计,包括采用支持向量机算法(SVM),遗传算法(GA),监督使神经网络算法(SNN)和快速分类算法(QC)进行数据分析并建立相应模型,得到分型区分的特征峰.结果 57株肺炎克雷伯菌中有28株携带rmpA2毒力基因,MLST均为ST11型,其中拉丝试验阳性有5株;29株不携带rmpA2毒力基因,主要ST型为ST11(n=23),还包括ST15(n=3),ST1、ST76和ST473各一株.质谱将肺炎克雷伯菌较清晰地划分成两个区域,ClinProTools软件可准确区分84.2%(48/57)的菌株.ClinProTools软件四种算法结果基本相似,SVM特异性和灵敏度最高,分别为93.23%和100%.采用ClinProTools对质谱峰进行统计显示,得到区分rmpA2基因阳性组和阴性组的2个特征峰分别为7168.9和7280.76,在峰强度上存在一定的差异.结论 MALDI-TOF MS快速区分携带rmpA2毒力基因的高毒力肺炎克雷伯菌方法灵敏度和特异性都在90%以上,得到两个特征峰在峰强度上存在一定差异,需进一步验证.

关键词：肺炎克雷伯菌、细菌蛋白质类、转录因子、光谱法、质量、基质辅助激光解吸电离

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资助基金：国家自然科学基金面上项目81772250;浙江省自然科学基金青年基金项目LQ16H200002

在线出版日期：2018-09-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：571-576