改进的四引物扩增受阻突变体系PCR方法同时检测叶酸代谢过程相关的四个单核苷酸多态性位点的研究

摘要：

目的 建立改进的四引物扩增受阻突变体系PCR(T-ARMS-PCR)检测方法,实现单管一次性检测叶酸代谢过程相关的4个单核苷酸多态性(SNP)位点:rs1801133,rs1801131,rs1805087和rs1801394.方法 方法学建立.于2017年1至4月在河北省儿童医院检验科收集150名体检儿童抗凝全血标本以待验证.利用T-ARMS-PCR原理及多重嵌合引物策略设计rs1801133、rs1801131、rs1805087及rs1801394的特异性内外嵌合引物.通过优化引物浓度和反应条件,经单管PCR反应,结合QIAxcel毛细管电泳分析扩增产物长度,判读150份标本的SNP基因型,同时所有标本经测序法进一步验证.利用SPSS 17.0统计软件卡方检验对150份标本的4个SNP位点分别进行哈迪-温伯格遗传平衡(HWE)检测.结果 改进的T-ARMS-PCR结合毛细管电泳分析的方法可在3 h内一次性识别本研究中叶酸代谢过程相关的4个SNP位点的8个不同等位基因,可对150份全血标本的SNP位点准确分型,其分型结果与测序法完全相符.4个SNP位点基因型的分布均符合HWE平衡定律(χ2rs1801133=0.69,Prs1801133=0.40; χ2rs1801131=0.21, Prs1801131=0.64; χ2rs1805087=3.32, Prs1805087=0.07;χ2rs1801394=1.91,Prs1801394=0.17).结论 本研究建立的改进的T-ARMS-PCR结合毛细管电泳分析方法,可准确地同时检测叶酸代谢过程相关的4个SNP位点,为指导人群特异性地补充叶酸提供了一种可能的技术手段.

关键词：叶酸、代谢、多态性、单核苷酸、聚合酶链反应、电泳、毛细管、DNA突变分析、DNA引物

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分类号：R3 ;S85

资助基金：河北省政府资助省级临床医学优秀人才项目;国家重点研发计划2016YFC1200900 Hebei Provincial Government to Support the Provincial Clinical medical Talents Project;National Key research and Development Plan2016YFC1200900

在线出版日期：2017-12-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：799-804