运用全基因组表达谱分析筛选肺腺癌不同TNM分期相关基因的研究

摘要：

目的 比较不同TNM分期肺腺癌样本的基因表达谱,筛选中国人肺腺癌TNM分期相关的差异表达基因.方法 采用病例-病例研究.选取第三军医大学西南医院2008年5月至2011年10月经手术切除治疗的240例肺腺癌患者.其中90份患者标本(TNM Ⅰ期、Ⅱ期、ⅢA期各30例)用于芯片杂交,其余150份患者标本(TNM Ⅰ期、Ⅱ期、ⅢA期各50例)用于后续验证研究.应用商品化的博奥晶芯(R) 35K Oligo基因芯片比较90例不同TNM分期肺腺癌的基因表达谱,筛选与肺腺癌TNM分期相关的差异表达基因.从中挑选Zimp7、GINS2及NAG-1共3个差异表达基因,应用实时荧光定量RT-PCR方法进一步验证它们在肺腺癌组织标本中的表达情况.受检基因在各期中表达水平的比较采用方差分析.结果 肺腺癌组织中共筛选到592个显著差异表达基因;其中264个肺腺癌相关高表达基因和328个低表达基因.在这592个基因中,进一步筛选不同TNM分期(Ⅰ期、Ⅱ期、ⅢA期)样本间的差异表达基因,共获得10个显著差异表达基因.实时荧光定量RT-PCR方法验证结果与芯片结果基本一致.结论 本研究共筛选到10个中国人肺腺癌TNM分期相关作用基因,预期将为揭示肺腺癌发生发展的内在作用机制,寻找肺腺癌诊断、治疗、预后判断的新靶点提供思路.

关键词：肺肿瘤、腺癌、肿瘤分期、基因表达谱、寡核苷酸序列分析

所属期刊栏目：36

分类号：R734.2;R318;S831.2

资助基金：重庆市科技攻关计划;重庆市自然基金

在线出版日期：2014-02-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：1104-1108