基因芯片诊断耐多药结核病的临床多中心研究

摘要：

目的 评估基因芯片法检测耐多药结核临床分离株的临床意义。方法采取分层抽样的方法分别从北京胸科医院、同济大学附属上海市肺科医院和广州市胸科医院保存的临床菌株库的耐药组和敏感组中，随机抽取利福平耐药株800株，异烟肼耐药株797株，耐多药株791株，利福平/异烟肼双敏感380株。用基因芯片法检测包括rpoB基因的511(T→C)、513(A→C，C→A)、516( G→T,A→T,A→G)、526( C→T,C→G,A→T,A→G)、531( C→T,C→G)、533( T→C)位点、katG的315(G→C，G→A)位点和inhA的-15(C→T)位点的耐药突变。以绝对浓度法药敏结果为金标准，计算基因芯片法的符合率、敏感度和特异度。同时对基因芯片法的核酸扩增产物进行测序，以验证基因芯片对核酸序列检测的准确性。结果以绝对浓度法药敏结果作为标准，基因芯片法检测利福平、异烟肼耐药和耐多药的符合率分别是93.7％(1 108/1 183)、83.8％ (994/1 186)、82.4％ (975/1 183)。检测利福平耐药的敏感度为92.0％ (733/797)，特异度为97.2％( 375/386)；检测异烟肼的敏感度为77.4％ (617/797)，特异度为96.9％ (377/389)；检测耐多药的敏感度为74.6％( 588/788)，特异度为98.0％(387/395)。在利福平基因芯片检测为突变的菌株中，突变频率最高的位点是531( TCG)，突变率为64.5％(480/744)；在katG/ inhA突变菌株中，基因芯片检测为katG 315( AGC)单突变的为77.4％(487/629)；且与测序结果基本一致，仅有5例菌株中不完全相符。其中1株异烟肼耐药菌基因芯片法检测为katG 315(G→C)突变，而测序结果为野生型，其余4株为基因芯片法未包含的突变类型。结论基因芯片法可快速可靠地检测结核临床分离株利福平和异烟肼的耐药性，有望在临床诊断中广泛应用。

关键词：分枝杆菌、结核、抗药性、多种、细菌、寡核苷酸序列分析、多中心研究

所属期刊栏目：34

分类号：R4(临床医学)

在线出版日期：2011-11-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：793-799