一项中国幽门螺杆菌耐药基因型及菌株谱系的全基因组测序研究

摘要：

幽门螺杆菌（
Helicobacter pylori, H. pylori）是胃癌Ⅰ类致癌物，根除
H. pylori能显著降低胃癌的发生率和死亡率。抗生素耐药是导致
H. pylori根除治疗失败的最重要因素，因此药敏指导下的个性化诊疗日益重要。为了加强对
H. pylori耐药机制的了解，并寻找新的耐药基因型位点，该研究从中国幽门螺杆菌分子医学中心（CCHpMM）菌株库复苏了60株
H. pylori，进行了耐药表型检测和全基因组测序（whole genome sequencing，WGS），并评价了耐药表型和基因型的一致性。结果显示克拉霉素和左氧氟沙星耐药基因型与表型几乎完全一致，Kappa系数分别为0.867和0.833。所有携带R16H/C突变和rdxA截断的
H. pylori都具有甲硝唑耐药性，特异性为100%。此外，研究还发现HP0399基因的A1378G突变和FabH基因的A149G突变两个新位点，可能分别导致了四环素耐药和多药耐药性。该研究结果表明，用克拉霉素和左氧氟沙星耐药基因型检测耐药是可靠的，WGS对发现新的
H. pylori耐药位点有很大帮助，并为发现
H. pylori新耐药机制提供了基础。

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在线出版日期：2023-05-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

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