致尤文肉瘤转移的关键基因及预后、调控分析

摘要：

目的:使用生物信息学技术分析转移性尤文肉瘤的关键基因及其预后、调控。方法:基于高通量数据筛选出了与尤文肉瘤（ES）转移相关的差异表达基因（DEGs），并将DEGs进行基因本体（GO）功能注释及京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。将富集结果结合基因表达水平验证及癌症基因组图谱（TCGA）数据库的生存分析，筛选关键基因。使用EWS-FLI1敲低的A673细胞系基因序列进行关键基因与EWS-FLI1之间表达量的相关性分析，并初步分析与ES转移相关的miRNA调控网络。结果:筛选出DEGs为380个。得到2条与ES转移相关的重要通路：错配修复（MMR）通路（
P=0.048）、丝裂原活化蛋白激酶（MAPK）信号通路（
P=0.037）；4个关键基因：MSH2、MSH6、CACNA2D2和MET。有61种miRNAs可能调控着关键基因的表达。ES患者的生存分析结果显示，4个关键基因的高表达量组5年生存率均低于低表达量组；TCGA数据库中肉瘤患者生存分析结果显示，4个关键基因的高表达也同样降低了患者的生存率，其在肉瘤的疾病进展中是危险因素。此外，与EWS-FLI1之间表达量的相关性分析显示，EWS-FLI1融合基因可能调控着4个关键基因的表达。
结论:目前的研究结果表明，MMR、MAPK通路及关键基因MSH2、MSH6、CACNA2D2和MET对ES增殖、侵袭和迁移有促进作用，并且与尤文肉瘤患者的预后相关。

关键词：尤文肉瘤、生物信息学、信号通路、生存分析、调控分析

所属期刊栏目：100

资助基金：国家自然科学基金青年科学基金81801213;Youth Program of National Natural Science Foundation of China81801213

在线出版日期：2023-05-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：1505-1510