基于宏基因组测序技术的糖尿病足骨髓炎微生物群落分析

摘要：

目的 分析糖尿病足骨髓炎(DFO)的微生物群落,为DFO病原菌的鉴定提供依据.方法 选取2016年9月至2017年4月于南方医科大学南方医院内分泌科住院治疗的5例确诊为DFO患者的感染骨组织,其中男3例,女2例,年龄(55.8±9.5)岁.利用宏基因组测序技术分析其微生物特点,并与16S rRNA测序结果进行比较.结果 宏基因组测序显示DFO微生物多样性明显,种水平共获得优势细菌22种,丰度最高的菌种是肺炎克雷伯菌(69.66％),其次是小韦永球菌(36.93％)、中间普雷沃菌(34.19％).与16S rRNA测序相比,宏基因组测序能在更少样本的基础上得到更多物种信息.在属水平,两种测序方法均显示DFO以厌氧菌为主.所有样本均为多细菌感染.结论 宏基因组测序技术能发现更多DFO菌群微生态的多样性及丰度特点.在种水平,能鉴定出更多16S rRNA测序技术无法分辨的细菌,甚至可以鉴定到菌株.属水平丰度最高的细菌是厌氧菌,种水平丰度最高的细菌是兼性厌氧菌.

关键词：宏基因组、序列分析、糖尿病足、骨髓炎、微生态群落

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资助基金：国家自然科学基金青年基金81600648;广东省医学科学技术研究基金A2017090;广东省科技计划项目2016ZC0066National Natural Science Foundation of China for Young Scholars81600648;Medicine,Science and Technology Research Foundation of GuangdongA2017090;Science and Technology Program of Guangdong2016ZC0066

在线出版日期：2019-08-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：2057-2061