深圳地区疱疹性咽峡炎疫情的柯萨奇病毒A4型VP1区基因特征分析

摘要：

目的 分析从2012年和2014年深圳市2起疱疹性咽峡炎疫情中获得的6株柯萨奇病毒A组4型(CVA4)的VP1区遗传进化特征.方法 采用荧光定量反转录(RT)-PCR法对疱疹性咽峡炎患儿咽拭子标本进行总肠道病毒(EV)、人肠道病毒71型(EV71)、柯萨奇病毒A组16型(CVA16)、CVA4、CVA6和CVA10进行检测,对CVA4阳性样本采用RT-PCR方法扩增其VP1区全长序列,并进行核苷酸序列测定和系统进化分析.结果 在2起疫情中共鉴定出6株CVA4病毒,均为GIb基因亚型.其中的2014年深圳CVA4病毒株与2012年深圳CVA4病毒株核苷酸的同源性仅为94.1％(变异率达5.9％);氨基酸的同源性为98.3％,共发现5个氨基酸突变aa22N-S、aa34T-A、aa63N-S、aa165A-D、aa200T-A.进化分析表明,2012年深圳CVA4病毒株与山东省KF150144株进化关系最近;而2014年深圳CVA4病毒株与吉林省JQ715709株的进化关系最近.结论 2014年深圳CVA4病毒株和2012年病毒株的VP1区存在较大的核苷酸变异,基因内部走势明显不同.

关键词：柯萨奇病毒A组4型、疱疹性咽峡炎、VP1区、基因型

所属期刊栏目：95

分类号：R373.2;R181;S828

资助基金：深圳市科技创新委项目JCY20130329160443121

在线出版日期：2015-05-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：1226-1229