免疫性血小板减少症患者血浆微小RNA差异表达谱的筛选与验证

摘要：

目的：筛选免疫性血小板减少症（ ITP）患者血浆差异表达微小RNA（ miRNA）。方法收集2012年6月至2013年9月天津市第一中心医院血液科就诊的25例ITP患者及同期20名健康体检者血浆，采用miRNA芯片检测血浆中miRNA表达谱，筛选ITP血浆差异表达的miRNA。通过靶基因预测程序TargetScan和miRanda进行潜在的靶基因预测，并进行基因本体和信号通路注释分析，探索可能与ITP发病相关的基因和信号通路，并用实时（ real-time） PCR对差异表达的miRNA进行验证。结果根据基因芯片结果，发现ITP患者血浆中存在29个差异表达的miRNA，其中上调15个，下调14个，通过靶基因预测程序TargetScan和miRanda预测出608个潜在的靶基因，基因本体分析显示参与生物学过程的基因占78.12％（475／608）；参与分子功能的基因占80.76％（491／608）；参与细胞组分的基因占87.66％（533／608），富集分析显示P＜0.05的基因本体有9个。通路分析显示157个信号通路与608个靶基因相关，富集分析P＜0.05的信号通路有25个。其中值得特别关注的信号通路是钙离子信号通路和 T 细胞受体信号通路。 real-time PCR 显示 ITP 患者血浆中miRNA4778-5p、miRNA4800-5p 显著高于健康对照，而 miRNA4707-5p、miRNA4721、miRNA3620-3p、miRNA378i显著低于健康对照（均P＜0.05），与芯片结果一致。结论 miRNA芯片初步筛选出ITP患者血浆miRNA差异表达谱，生物信息学分析提示钙离子信号通路和T细胞受体信号通路可能与ITP患者发病和进展有关。

关键词：微RNAs、计算生物学、免疫性血小板减少症

分类号：R73;TP3

资助基金：天津市卫生局科技攻关项目13KG106

在线出版日期：2014-11-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：1083-1086