甲型H7N9流感病毒血凝素和神经氨酸酶的进化及抗原位点变异分析

摘要：

目的 分析甲型H7 N9流感病毒的血凝素(HA)、神经氨酸酶(NA)进化及其抗原位点变异.方法 从美国国立生物技术信息中心(NCBI)和全球共享禽流感数据倡议组织(GISAID)数据库检索并下载从建库到2013年4月13日的H7N9病毒HA、NA的基因和氨基酸序列.应用Clustal-W、MEGA 5.0、NetNGlyc 1.0 Server、DNAMAN等生物信息学软件,对HA、NA的基因序列和氨基酸序列进行比对分析以及预测其潜在的抗原位点.结果 共有26条HA基因和氨基酸序列以及24条NA基因和氨基酸序列纳入分析.美洲地区的H7N9流感病毒HA、NA基因和氨基酸的保守性较亚欧地区高.HA、NA基因进化分为亚欧地区和美洲地区两大系.所有病毒HA裂解位点附近仅含1个碱性氨基酸R(Arg).HA蛋白裂解位点和NA蛋白糖基化位点表现出地区差异,HA蛋白糖基化位点保守.HA、NA蛋白在亚欧地区和美洲地区有多个抗原位点发生变异.7例中国分离的新型H7N9病毒进化位于亚欧地区分支,NA的茎部在69～ 73位有5个氨基酸缺失,HA蛋白裂解位点、糖基化位点未发生变异,HA、NA蛋白多个抗原位点发生了与其他病毒株不同的变异.结论 H7N9病毒HA、NA进化表现出地区差异性.NA茎部氨基酸的缺失和HA、NA蛋白多个抗原位点的变异可能与人感染H7N9流感爆发有关.

关键词：流感病毒A型,H7N9亚型、血凝素类、神经氨酸酶、抗原位点、进化,分子

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在线出版日期：2013-09-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：2381-2384