10.3760/cma.j.issn.0376-2491.2013.07.017
我国B'亚型HIV-1 gag基因变异与宿主HLA限制性CTL应答的关系
目的 了解我国B'亚型HIV gag基因随时间进化的特征及阳性选择位点与宿主HLA限制性CTL应答的关系.方法 从HIV序列数据库下载我国B’亚型HIV-1 gag序列,计算不同年代病毒多样性及基因离散率,应用Hyphy软件分析Gag蛋白阳性选择位点及其与HLA限制性CTL应答的关系.结果 本研究共获得来自河南、湖北、辽宁及云南地区的122条B '亚型gag序列,按采样时间分为4组:<2001、2001-2003、2004-2006及2007-2010年,病毒多样性及离散率均随时间逐渐增加(r1=0.497,P1<0.001;r2 =0.593,P2<0.001);Gag蛋白34个阳性选择位点中97.1%位于已明确的47个HLA限制性CTL表位内,HLA-A、B、C限制表位分别占43.1%、49.0%及7.9%.结论 我国B’亚型gag基因多样性及离散率随着流行时间延长逐渐增加,B '亚型毒株正逐渐适应我国人群常见的HLA限制性CTL应答,提示该毒株疫苗研发时需要注意避免选用相关CTL表位为免疫原.
HIV-1、基因、gag、生物多样性
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R512.62;R735.7;R373.2
国家科技重大专项;国家自然科学基金
2013-04-26(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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