我国B'亚型HIV-1 gag基因变异与宿主HLA限制性CTL应答的关系

摘要：

目的 了解我国B'亚型HIV gag基因随时间进化的特征及阳性选择位点与宿主HLA限制性CTL应答的关系.方法 从HIV序列数据库下载我国B’亚型HIV-1 gag序列,计算不同年代病毒多样性及基因离散率,应用Hyphy软件分析Gag蛋白阳性选择位点及其与HLA限制性CTL应答的关系.结果 本研究共获得来自河南、湖北、辽宁及云南地区的122条B '亚型gag序列,按采样时间分为4组:＜2001、2001-2003、2004-2006及2007-2010年,病毒多样性及离散率均随时间逐渐增加(r1=0.497,P1＜0.001；r2 =0.593,P2＜0.001)；Gag蛋白34个阳性选择位点中97.1％位于已明确的47个HLA限制性CTL表位内,HLA-A、B、C限制表位分别占43.1％、49.0％及7.9％.结论 我国B’亚型gag基因多样性及离散率随着流行时间延长逐渐增加,B '亚型毒株正逐渐适应我国人群常见的HLA限制性CTL应答,提示该毒株疫苗研发时需要注意避免选用相关CTL表位为免疫原.

关键词：HIV-1、基因、gag、生物多样性

所属期刊栏目：93

分类号：R512.62;R735.7;R373.2

资助基金：国家科技重大专项;国家自然科学基金

在线出版日期：2013-04-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：541-545