HULC RNA在肝癌细胞中的表达及其对邻近基因SLC35B3表达的影响

摘要：

目的 探讨长片段非编码RNA--肝癌高表达基因(HULC)RNA在不同的肿瘤细胞系中的表达情况以及对其邻近基因表达的影响.方法 应用反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)方法 在不同来源的肿瘤细胞系中检测HULC RNA的表达情况,并通过生物信息学的方法 寻找与其邻近的基因,再通过实时PCR技术检测HULC对邻近基因的表达情况的影响.结果 在检测的8株细胞系:人胚肾细胞系293T,食管癌细胞系EC9706、KYSE150,结肠癌细胞系HCT116,肝癌细胞系SMMC7721、HepG2以及肺癌细胞系H446、H1229中,非编码RNA HULC在HepG2细胞中的表达量特异性升高.HULC基因的附近(＜1000 bp)没有编码基因存在,与其距离最近的基因是SLC35B3,且间距在约200 000 bp.与HULC RNA表达量较低的SMMC-7721细胞相比,内源性高表达HULC RNA的HepG2细胞中SLC35B3的转录更高[(0.477±0.040)%比(0.129±0.004)%,P＜0.01].在SMMC7721细胞中转染pcDNA3.1-HULC质粒后,其邻近基因SLC35B3表达略微升高.而通过RNA干扰的方法 敲降HULC RNA后,SLC35B3基因的表达也随之下降.HepG2细胞转染2条小干扰RNA(siRNA)后,SLC35B3基因的表达分别为[(0.283±0.007)%和(0.387±0.015)%],并且第1条siRNA转染后与阴性对照[(0.477±0.042)%]比较差异有统计学意义(P＜0.01).结论 肝癌细胞HepG2中特异性高表达的非编码RNA HULC对其邻近基因SLC35B3的表达有一定影响作用.

关键词：RNA、未翻译、计算生物学、肝癌高表达基因RNA、基因、SLC35B3

所属期刊栏目：90

分类号：R73(肿瘤学)

资助基金：国家重点基础研究发展计划"973"项目基金2009CB521801

在线出版日期：2010-12-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：3156-3159