靶向上调ID4基因表达药物的生物信息学预测和初步验证

摘要：

目的 筛选具有靶向上调ID4基因表达的药物.方法 钓取ID4基因5'侧翼区3000 bp非编码DNA序列和mRNA序列中的开放阅读框(ORF);利用启动子分析软件在人类转录因子数据库中搜索可能存在的顺式结构;利用基因表达数据库分析影响ID4基因表达的相关药物,并做药物调控人类基因表达谱的相似性分析.将筛选出的活性药物与急性淋巴细胞白血病细胞系MOLT4共培养,RT-PCR方法检测ID4基因在药物作用前后的表达情况.结果 ID4基因具有Ⅱ型启动子,在5'非翻译区的-45 bp处有一个典型的TATA盒.在长度为1300 bp的ID4启动子区,存在多个顺式结构,其中转录因子Spl、c-Myb、环磷腺苷、糖皮质激素受体和雌激素受体可能具有正向调控作用;Wilms瘤基因(WT1)和早期生长反应基因2(EGR2)可能具有负向调控作用.环磷腺苷与ID4基因对人类基因表达谱的调控具有相似性.浓度为0.1 mmol/L的二丁酰环磷腺苷具有诱导MOLT4细胞表达ID4基因的作用.结论 启动子调控序列预测、基因表达谱相似性分析和文献检索相结合的生物信息学分析法有助于寻找调控目的 基因表达的药物.二丁酰环磷腺苷具有诱导IIM基因在白血病细胞中表达的作用.

关键词：白血病、计算生物学、基因、ID4

所属期刊栏目：89

分类号：R3(基础医学)

资助基金：国家自然科学基金30772597;30873086

在线出版日期：2009-07-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共3页

页码：1714-1716