利用mRNA差异显示和基因芯片技术联合筛选乳腺原发癌与淋巴结转移癌患者的差异表达基因

摘要：

目的 通过乳腺原发癌与配对的淋巴结转移癌基因表达谱的比较研究筛选乳腺癌转移相关基因.方法 首先利用mRNA差异显示(mRNA DD)技术筛选乳腺原发癌与其配对的淋巴结转移癌的差异表达基因片段,将差异基因片段克隆、测序并与GenBank同源性比较;然后利用同位素标记的反向斑点杂交和荧光标记的基因芯片杂交方法 验证筛选得到的差异基因;采用实时定量逆转录聚合酶链反应(real-time RT-PCR)方法 检测差异表达基因在7个不同生物学行为乳腺癌细胞系的mRNA表达.结果 乳腺癌的淋巴结转移癌与其原发癌的基因表达谱具有高度一致性,但也有少量差异表达的基因;mRNA DD筛选得到16个差异基因,包括4个未知基因并已登录在GenBank,序列号为BG518428、BG518429、BM005520、BM005521,4个已知序列未知功能基因和8个已知基因.其中驱动蛋白样DNA结合蛋白(KNSL4)和二氢嘧啶脱氢酶(DYPD)为在同位素标记的反向斑点杂交和基因芯片杂交的验证结果中证实在转移癌中的表达较原发癌下调的基因.KNSL4 mRNA在7个不同生物学行为乳腺癌细胞系的表达,随着细胞转移能力的增强呈下调趋势.结论 乳腺原发癌与配对的淋巴结转移癌基因表达谱的相似性证实,淋巴结转移癌是其原发癌的转移亚克隆,二者的差异表达基因可能与细胞的转移表型相关;KNSL4和DYPD为3种方法 均证实的在转移癌中表达下调的基因,是潜在的乳腺癌转移相关基因;KNSL4与乳腺癌细胞转移的生物学行为相关,提示其可能在乳腺癌转移中起重要作用.

关键词：乳腺肿瘤、肿瘤转移、基因

所属期刊栏目：86

分类号：R73(肿瘤学)

资助基金：国家自然科学基金30471671;天津市高等学校科技发展基金20010803

在线出版日期：2006-11-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：2749-2755