中国云南少数民族地区慢性乙型肝炎患者病毒基因型的鉴定

摘要：

目的研究乙型肝炎病毒(HBV)基因型在不同民族慢性乙型肝炎(CHB)患者中是否存在进化差异及临床意义.方法应用聚合酶链反应(PCR) 对中国云南少数民族地区50例CHB患者(25例少数民族CHB患者与对照组25例汉族CHB患者)HBV前S2/S(pre S2/S)和C(core,C)基因进行扩增,将PCR扩增产物克隆到载体pBS (pBluescriptⅡSK,pBS)上进行测序分析.结果50例患者HBV preS2/S基因全长846 bp,GC含量占49.1%,编码281个氨基酸(aa);C基因全长552 bp,GC含量占46.1%,编码183个aa.并在GenBank登录注册(AY517619、AY517620、AY517488、AY517489、AY517598、AY517599).通过与GenBank数据库中HBV基因及亚型序列比较,发现全部患者HBV基因与ayw1亚型具有高度同源性,preS2/S基因aa同源性为97.5%～98.6%,C基因aa同源性为94.5%～97.8%.所有患者S基因在"a"抗原决定簇aa第122位为精氨酸(AGA)、第160位为赖氨酸(AAA).发现全部患者HBV基因型均为B型(属ayw1亚型),未发现其他基因型.HBV准种发生频率为4%.25例少数民族CHB患者之间与对照组25例汉族患者之间HBV基因型B差异比较,差异无统计学意义(P＞0.05).所有患者preS2/S基因均存在aa 124精氨酸(R)→赖氨酸(K124)(1.1%)、172亮氨酸(L)→脯氨酸(P172)(1.3%)、306蛋氨酸(M)→苏氨酸(T306)(1.5%)和361异亮氨酸(I)→蛋氨酸(M361)(1.6%)的aa替代,其发生替代的频率>1%.但所有患者发生aa145甘氨酸(G)→精氨酸(R)(0.4%)替代的频率<1%.50例患者C基因在T细胞和B细胞表位存在27～63、80～110、135～153位间aa变异,其中45例患者C基因由于nt 1979A→G,nt 2012T→A,nt 2088G→T,nt2304C→A和nt 2339A→G的变异,分别引起V27、N38、V63、Q135和A147的aa替代,其发生替代的频率>1%.而另外5例重型CHB患者C基因由于nt 2159A→G,nt 2189A→C的变异,分别引起甘氨酸(G87)和亮氨酸(L97)的aa替代.所有患者preS2/S和C基因中未发现碱基的插入或缺失.结论中国云南少数民族地区HBV流行毒株为基因型B(属ayw1亚型,包括发现25个少数民族CHB患者为基因型B),基因型B与不同民族无相关性.HBV病毒载量可作为判定CHB患者预后的重要参数.

关键词：肝炎病毒、乙型、序列分析、基因型、少数民族

所属期刊栏目：86

分类号：R5(内科学)

在线出版日期：2006-05-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：681-686