基因芯片在中国南方汉族人白细胞抗原-DRB分型中的应用

摘要：

目的建立一种用于HLA-DRB分型的基因芯片,并通过与PCR-SSP比较,评价芯片的性能.方法根据中国汉族南方人常见的HLA-DRB位点基因及其多态性的独特序列,在第二外显子区域设计特异性的寡核苷酸分型探针,将其点在玻片上,制成芯片.基因组DNA通过组间特异引物扩增,扩增中同时用荧光素Cy5标记.扩增标记后的产物与结合在芯片上的探针进行杂交,通过荧光扫描仪对杂交产生的荧光信号值进行分析,确定样品的HLA-DRB基因亚型.将这一方法应用于110份样本的HLA-DRB基因分型并与PCR-SSP分型的结果进行比较.结果110份淋巴细胞样本,除1份PCR无产物致芯片不能分型外,其余样本芯片分型全部成功.不吻合样本10份:其中SSP定型纯合子6份,芯片分型全部为杂合子,SSP定型为杂合子1份,芯片结果为纯合.经第三方用PCR-SSO验证,证实芯片分型正确.另外3份不吻合的样本经测序,证实SSP分型错误2份,芯片分型错误1份.芯片的重复率为95%.结论基因芯片是一种理想的分型方法,具有特异性高、重复性好、操作简便、所需样本量少、结果判读容易、一次可作多份样本的优点.

关键词：人白细胞抗原、基因分型、移植、基因芯片

所属期刊栏目：83

分类号：R55(血液及淋巴系疾病)

资助基金：军队杰出人才基金01J003;上海市科委资助项目024919005

在线出版日期：2004-01-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：417-420