肝炎基因诊断芯片对丙型肝炎病毒基因分型检测的初步研究

摘要：

目的研究丙型肝炎病毒(HCV)基因分型诊断芯片的制备和其对丙型肝炎患者血清HCVRNA基因分型诊断的准确性.方法根据丙型肝炎病毒5′端非编码区末端(5UTR)和C区设计引物和特异性探针,将设计的20条特异性寡核苷酸探针用核苷酸合成仪合成后,配制成浓度为50 μmol/ml的点样液,用点样仪点到特殊处理的玻片介质上,制成丙型肝炎病毒基因分型诊断芯片.收集HCV RNA阳性的丙型肝炎患者血清60份作为实验组,健康人血清60份作为对照组.用荧光定量PCR仪对两组血清进行HCV RNA定量检测,实验组血清HCVRNA含量均大于500拷贝/ml,对照组血清HCV RNA含量均小于500拷贝/ml.两组血清进行HCV RNA分离纯化、逆转录反应、巢式PCR扩增后,分别用基因芯片、HCV RNA核酸序列测定法(美国Li-Cor核酸序列测定仪)进行双盲丙型肝炎基因分型检测.结果实验组血清基因诊断芯片检测均为阳性;基因分型:1b型46例,3a型3例, 3b型3例,2a型2例, 2b型2例,混合型1b+2a 2例,1b+3b型2例;核酸序列测定分型1b型50例,3a型3例,3b型3例,2a型2例,2b型2例;基因诊断芯片检测和核酸序列测定检测的基因分型结果符合率为93.3%.对照组血清基因芯片检测均阴性.结论肝炎病毒基因诊断芯片可以用于检测血清HCV RNA,并进行基因诊断分型,准确率较高.

关键词：C型肝炎样病毒属、基因型

所属期刊栏目：82

分类号：R37(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：江苏省科技厅科研项目BS2000028

在线出版日期：2004-01-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：1249-1253