贵州2012—2015年风疹病毒分离株基因特征分析

摘要：

目的 分析贵州2012—2015年风疹病毒分离株基因特征.方法 于2012—2015年贵州省麻疹网络实验室共采集390例疑似麻疹病例,并从中诊断出25例风疹病例,使用Vero/SLAM细胞进行病毒分离.经Real-time RT-PCR方法 鉴定为阳性的风疹病毒分离株,采用RT-PCR方法 扩增风疹病毒E1基因两个核苷酸片段(480 bp和633 bp),在对扩增产物进行序列测定和拼接后,基于基因定型靶基因(739 bp)进行基因特征分析.结果 25例疑似风疹病例中,19例为风疹暴发病例,6例为风疹散发病例;男性11例(44.0%),女性14例(56.0%),年龄为(12.3±3.9)岁;共分离到10株风疹病毒株, 7株为1E基因型,3株为2B基因型.7株1E基因型间核苷酸和氨基酸同源性分别为99.0%~100%和100%;3株2B基因型间核苷酸和氨基酸同源性分别为99.4%~100%和99.5%~100%.10株风疹病毒在E1糖蛋白基因Asn 177、Asn 209 N-型糖基化位点以及位于213~285 aa之间E1抗原表位未发生变异.其中,7株1E基因型在第338位氨基酸由亮氨酸变异为苯丙氨酸;2株2B基因型在第377位氨基酸由缬氨酸变异为丙氨酸.结论 2012—2015年在贵州传播流行的风疹病毒是由1E和2B基因型引起;10株风疹病毒株在核苷酸和氨基酸序列水平上高度保守,重要功能位点均未发生变异.

关键词：风疹病毒、基因型、序列分析

所属期刊栏目：51

分类号：R37;R71

在线出版日期：2018-01-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：1108-1112