2014年吉林省水痘-带状疱疹病毒基因特征分析

摘要：

目的 分析吉林省水痘-带状疱疹病毒(VZV)野毒株的基因型别,区分疫苗株与野毒株.方法 选择2014年1-12月在吉林省收集的13份疑似水痘患者的疱疹液或咽拭子样本.提取样本DNA,采用DNA PCR扩增病毒基因组的15个开放阅读框(ORF),结合单核苷酸多态性(SNP)法确定病毒株的基因型别;用PCR-限制性片段长度多态性聚合酶链反应(PCR-RFLP)方法区分野毒株与VZV减毒活疫苗(v-Oka疫苗株).整理序列资料,从GenBank数据库下载VZV各基因型参考株的序列资料,采用MEGA5软件进行基因序列对比分析.结果 13份疑似水痘患者的疱疹液或咽拭子样本中,5份来自男性,8份来自女性,患者年龄为(16.69±5.48)岁,范围为11～27岁,出疹后采样日期为0～3 d.13份疑似样本中,8份为VZV阳性.SNP分析显示,8份阳性样本均来自Clade 2遗传支;与v-Oka疫苗株相比,8份样本在SNP 18082位点上均发生了T＞C的同义突变.PCR-RFLP方法区分野毒株与疫苗株结果显示,8份临床样本均为野毒株(Pst Ⅰ +BgⅡ+SmaⅠ-),无疫苗相关病例.结论 吉林省流行的水痘-带状疱疹病毒均属Clade 2遗传支,且均为野毒株.

关键词：水痘病毒属、基因型、疫苗、野毒株

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分类号：R373.2;S828;S433.7

在线出版日期：2016-10-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：738-742