大肠埃希菌的群体基因组学研究

摘要：

将群体遗传学的理论与方法应用于特定种群多个分离株的全基因组序列中，进行数据挖掘和分析的学科称为群体基因组学(population genomics)。近年来，测序技术的迅猛发展使得低成本、快速获得大量个体全基因组序列成为可能，这推动了群体基因组学在进化领域的广泛应用。本文以经典模式生物大肠埃希菌为例，回顾了大肠埃希菌A、B1、B2、D和E五个基因型之间进化关系的确立历程；总结了基因组突变率、选择信号以及适应性进化模式的分析实例；并对群体基因组学在应对O157：H7和O104：H4菌株所致疫情暴发中的应用进行了综述。这些研究结果说明，尽管发展时间较短，群体基因组学在解析细菌种群结构、探索进化规律以及疾病暴发应对等领域已经发挥了重要作用；加强该学科研究对大肠埃希菌以及其他病原细菌的进化与防控研究工作均有积极意义。

关键词：大肠杆菌、基因组、遗传学、群体、种群结构、流行病学

所属期刊栏目：50

分类号：O65;S5

资助基金：Fund program:National Science and Technology Major Project of China2012ZX10004215;National Natural Science Foundation of China 31430006@@@@【基金项目】国家科技重大专项2012ZX10004215；国家自然科学基金31430006

在线出版日期：2016-06-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：554-558