应用单基因组扩增法分析HIV-1准种基因变异

摘要：

目的：探索应用单基因组扩增分析HIV-1准种基因变异。方法将深圳2010年6个基因测序出现重叠峰的样本RNA稀释至单拷贝，采用一步法RT-PCR套式扩增，扩增产物纯化后进行基因测序，应用Mega 4.02多功能基因分析软件分析不同准种序列的基因距离，构建进化树模型。同时，测定样本的CD4＋T淋巴细胞浓度和病毒载量。结果同一感染者体内HIV-1准种在进化树上形成了各自独立的簇，有些簇存在明显的亚簇，表明某些病毒株在复制中具有竞争优势。6个样本HIV准种的基因距离介于0.008与0.06之间，与感染持续时间和病毒载量有关。结论单基因组扩增法可以很好地分辨出HIV-1准种的基因变异，对于HIV-1准种基因距离的分析可以判断感染时间和分析免疫逃逸机制，其相关影响因素尚需更大样本的分析。

关键词：HIV、基因扩增、准种、有限稀释法

分类号：TU2;G63

资助基金：2012年深圳市科技计划项目201202095

在线出版日期：2014-10-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：819-822