HIV-1CRF_07BC重组型逆转录酶区耐药进化通路分析

摘要：

目的 探讨HIV-1的CRF_07BC重组型在药物压力下的进化通路,并与B亚型进行比较.方法 病毒样本来自2007-2011年新疆维吾尔自治区和四川省参加艾滋病多中心队列研究的共862例AIDS患者.根据未治疗的588例和治疗的274例AIDS患者病毒样本的逆转录酶区序列,采用选择压力的方法识别耐药相关位点,使用贝叶斯网络法构建CRF 07BC重组型在抗病毒治疗下的耐药进化通路,同时利用国际HIV耐药数据库中的数据构建B亚型在相同治疗方案下耐药进化通路,并与CRF_07BC重组型进行比较.结果 预测的CRF_07BC重组型主要耐药位点为K103N、Q197K、V179D和Y188L.预测的B亚型主要耐药位点为M184V、K103N、Y181C、T69N、G190A、K238T、Y188H和P225H.两者重叠较小,但经典的TAM1(41L、210W和215Y)和TAM2(67N、70R和219E/Q)通路均存在于两个病毒类型中.不同于B亚型的是,预测的CRF_07BC重组型的主要耐药位点中不包含TAM相关突变,并且在核苷类药物相关突变与非核苷类药物相关突变之间存在强的依赖关系.结论 HIV-1 CRF_07BC重组型形成了以K103N、Q197K、V179D和Y188L为主要耐药位点的独特耐药进化通路,并与B亚型的耐药进化通路有较大差异.

关键词：HIV、生物进化、CRF_07BC、耐药进化通路、耐药位点

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资助基金：传染病预防控制国家重点实验室自主研究重点课题2011SKLID102;国家自然科学基金30872232,81172733;国家科技重大专项2012ZX10001-002

在线出版日期：2014-04-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：301-306