新型GⅡ.4诺如病毒重组株感染疫情的分子流行病学研究

摘要：

目的 分析老年护理院诺如病毒(norovirus,NoV)胃肠炎疫情流行病学特征及其所感染病毒的基因型别.方法 2013年1月29日,上海市金山区某老年护理院发生了一起由NoV感染引起的急性胃肠炎疫情,以26例患者作为研究对象,对其进行个案调查.采用单纯随机抽样方法,抽取未经治疗的9例患者,采集其粪便或肛拭子样本9份,再从中抽取4例患者,采集其病房门把手表面涂抹样本或马桶坐垫表面涂抹样本4份.运用荧光RT-PCR对样本进行NoV核酸检测,对核酸检测阳性的样本进行常规RT-PCR,对PCR产物进行纯化回收及测序,测序序列经核酸比对确认,应用Clustal X、MEGA 5.1等软件分析基因序列,构建系统进化树.结果 在26例患者中,男性7例,女性19例.经荧光RT-PCR检测的13份样本中,NoV核酸阳性8份.序列比对分析结果显示,获得测序信号的Jinshan08、Jinshan12分离株间核苷酸序列同源性为100％ 进化树分析结果显示,在RdRp区,Jinshan08 、Jinshan12分离株与GⅡ.e/NV2634/BCN/Spain/2008株等在进化树的同一分支上,可信度为99％,在Capsid的N/S区,2分离株与Lordsdal株等在进化树的同一分支上,可信度为97％.结论 本次疫情是由新GⅡ.4型NoV重组株感染引起的急性胃肠炎暴发疫情.

关键词：诺罗病毒、胃肠炎、基因、暴发、重组

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资助基金：上海市金山区科委创新基金项目2011-3-09

在线出版日期：2014-01-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：1114-1117