2009-2011年青岛市甲型H1N1流行性感冒病毒全基因组特征分析

摘要：

目的 了解2009-2011年青岛地区甲型H1N1流行性感冒病毒(简称流感病毒)的全基因组特征.方法 选取2009-2011年青岛地区流行的甲型H1N1流感病毒35株,提取病毒RNA,应用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)扩增各基因片段,并进行序列测定;用Sequencher软件完成序列拼接.选取GenBank收录的25条全球同期甲型H1N1流感病毒血凝素(HA)基因全长序列作为参照,用Mega 5.0软件对各基因片段进行系统发育分析及分子特征分析;下载2010年8月至2011年3月间全球分离的1068条该型HA序列用于氨基酸变异分析.结果 在HA基因进化树上,2009-2010、2010-2011年监测季毒株各分列4个分支,每监测季各有一个优势分支.2009-2010年监测季优势分离株HA基因核苷酸同源性为99.6％～99.9％,编码氨基酸同源性为99.1％ ～ 99.8％,2010-2011年监测季优势分离株HA基因核苷酸同源性为99.1％ ～ 99.6％,编码氨基酸同源性为98.2％ ～99.1％,两季优势分离株间HA基因核苷酸同源性为98.8％～99.8％,编码氨基酸同源性为98.0％～99.6％.病毒HA蛋白与疫苗株比较,各监测季分别有14、12处氨基酸变异,涉及10个抗原位点及5个阳性选择位点.神经氨酸酶(NA)蛋白247位、274位氨基酸均分别为丝氨酸(247S)、组氨酸(274H),M2蛋白31位氨基酸均为天冬酰胺(31N).结论 2009-2011年青岛地区流行的甲型H1N1流感病毒在持续不断地发生变异而产生抗原漂移;毒株全部为烷胺类药物耐药株,但对神经氨酸酶抑制剂敏感.

关键词：流感病毒A型、基因组、抗原变异

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资助基金：青岛市公共领域科技支撑计划10-3-3-8-1-nsh

在线出版日期：2014-01-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：1105-1109