2009-2011年广州环境与临床标本中诺如病毒的分子流行病学特征

摘要：

目的 调查2009-2011年广州诺如病毒的分子流行病学特征.方法 分别收集广州市2010年1月至2011年5月的环境水样183份、2009年6月至2011年6月的海产品1162份和2009年7月至2010年12月的腹泻患者粪便标本1066份,以实时荧光定量逆转录PCR (qRT-PCR)检测诺如病毒,对扩增阳性标本测序后与GenBank中的诺如病毒参考株比较,绘制系统进化树.结果环境水样中诺如病毒阳性率为19.67％(36/183),海产品中的阳性率为8.26％(96/1162),腹泻患者粪便标本中的阳性率为37.05％(395/1066);扩增阳性样品中的诺如病毒可分为10株代表株,其中7个代表株(共208份标本)的基因型为G2-4型,并且水样、海产品和粪便标本同源性很高,相似度达94％ ～ 100％.结论 广州诺如病毒流行优势株为G2-4型,同时标本中阳性率较高.

关键词：诺罗病毒、分子流行病学、聚合酶链反应

所属期刊栏目：47

分类号：R378;R735.7;R446.61

资助基金：广东省科技计划;广州市医药卫生科技重点项目

在线出版日期：2013-04-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：40-43