中国地区丙型肝炎病毒的NS5A基因序列及干扰素敏感决定区特征分析

摘要：

丙型肝炎病毒(Hepatitis C virus,HCV)NS5A基因编码的ISDR、PKRBD和V3等区域氨基酸序列的变异与HCV对干扰素-α( interferon-α,IFN-α)治疗的不同反应性有关[1-6],了解NS5A基因的序列特征及干扰素敏感决定区(IFN Sensitivity Determining Region,ISDR)的氨基酸序列有助于进一步研究中国地区HCV的致病性及HCV相关肝炎的药物治疗与预后.笔者选取了美国国立生物技术信息中心数据库(NCBI)中发表的中国地区HCV多聚蛋白的核苷酸和氨基酸序列及NS5A蛋白的部分氨基酸片段,对NS5A基因序列及ISDR氨基酸序列进行多序列比对、聚类分析、相似性分析及氨基酸变异位点分析,分析中国地区HCV的NS5A基因序列及ISDR特征,现将结果报道如下.

机标关键词：中国、地区、丙型肝炎病毒、基因序列、干扰素、决定区、氨基酸序列、中心数据库、治疗与预后、相似性分析、多序列比对、序列特征、聚类分析、技术信息、基因编码、多聚蛋白、变异位点、致病性、核苷酸、反应性

所属期刊栏目：46

分类号：R512.63(传染病)

资助基金：国家“十一五”科技重大专项2009ZX10004-903

在线出版日期：2012-12-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：857-859