基于基因表达芯片和连接网络技术筛选干预缺氧诱导视网膜血管内皮细胞模型的小分子化合物研究

摘要：

目的 利用基因表达芯片技术和连接网络(CMAP)技术筛选干预缺氧诱导视网膜血管内皮细胞模型的小分子化合物和药物.方法 将前期研究获取的CoCl2诱导的缺氧人胚视网膜微血管内皮细胞模型中包括上调和下调的326个差异表达基因建立成查询签名格式文件,进入CMAP.通过疾病特征性差异基因谱与CMAP中的对照基因表达谱之间的逐一比对,获取正相关和负相关的小分子化合物和药物.进一步检索文献,了解其作用机制,对照早产儿视网膜病变(ROP)的发病机制,筛选与ROP正相关或负相关的化合物.结果 差异表达基因CMAP检索发现,44种小分子化合物和药物与ROP存在正相关;18种小分子化合物和药物与ROP存在负相关.文献检索发现,环吡酮胺、CoCl2、棉酚和醉茄素A与ROP有正相关;环腺苷酸、去甲骆驼蓬碱、柚皮甙和丙磺舒与ROP有负相关.结论 环吡酮胺、CoCl2、棉酚和醉茄素A与ROP有正相关;环腺苷酸、去甲骆驼蓬碱、柚皮甙和丙磺舒与ROP有负相关.

关键词：早产儿视网膜病/预防和控制、基因表达、预测、计算生物学

所属期刊栏目：32

分类号：R774.1;R394.3(眼科学)

资助基金：国家自然科学基金71173055National Natural Science Foundation of China 71173055

在线出版日期：2016-12-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：591-595