单细胞测序分析人类胚胎干细胞神经分化的分子机制

摘要：

目的:探讨人类胚胎干细胞（ESCs）分化为神经细胞的关键性靶基因及分子机制，为临床靶向治疗神经康复患者提供分子理论依据。方法:基于GEO数据平台芯片，采用单细胞测序方法（scRNA-seq），利用R语言从多分子维度（单细胞差异基因、蛋白互作网络和基因通路等）分析人类ESCs分化过程中的关键Marker基因并利用质控和数据过滤、PCA、TSNE分析、细胞轨迹分析、GO富集分析、KEGG富集分析、KEGG通路分析等论证Marker基因调控人类ESCs分化作用机制。结果:GO功能富集分析结果为：Marker基因在胚层分化、细胞外基质和信号转导中作用显著；Marker基因互作网络及KEGG通路显示了特征性纤维连接蛋白1（FN1）、同源域蛋白（NANOG）、生长因子受体结合蛋白2（GRB2）为关键基因；KEGG通路分析显示：（1）FN1在调控细胞外基质通路中作用显著；（2）NANOG、GRB2在调控干细胞多能性信号通路作用显著。结论:FN1可能通过调控细胞外基质通路介导人类ESCs基质环境的变化；NANOG、GRB2上调在干细胞多能性信号通路中高表达介导人类ESCs定向分化为神经组织。

关键词：人类胚胎干细胞、神经祖细胞、单细胞测序、靶基因、分子机制

所属期刊栏目：11

资助基金：厦门市第五医院科研课题50193

在线出版日期：2022-07-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：1-7