10.3760/cma.j.cn112309-20230210-00026
2021—2022年流感监测季北京市乙型Victoria系流感病毒血凝素基因特性和抗原性分析
目的:分析2021—2022年流感监测季北京市乙型Victoria系流感病毒(BV)的血凝素(hemagglutinin, HA)基因特性、抗原性及与流感疫苗组分株的匹配性。方法:采集2021—2022年流感监测季流感样病例(influenza like-illness, ILI)咽拭子样本经MDCK和鸡胚培养分离流感病毒,提取病毒核酸后测序。应用MEGA5.0进行病毒HA基因的核苷酸和氨基酸变异,采用maximum likelihood方法构建HA基因的遗传进化树,在线预测N-糖基化位点。SWISS-MODEL同源建模,建立BV毒株HA的蛋白质三维空间模拟图。通过血凝抑制(hemagglutination inhibition, HI)试验,进行毒株的抗原性分析。结果:共收集402株BV毒株,选取58株测序获得HA基因全长序列,与本年度的疫苗组分BV株(B/Washington/02/2019)HA基因相比较显示,有27个氨基酸位点发生变异,其中11个变异位点位于4个不同的抗原决定簇。遗传进化树分析显示:3个进化分支的毒株共同流行,其中54株(54/58,93.10%)HA基因位于Clade 1A.3a2分支,2株(2/58,3.45%)位于Clade 1A.3a1分支上,2株(2/58,3.45%)与2021—2022年度疫苗组分BV株在同一分支Clade 1A.3。其中2株相对于疫苗组分BV株增加一个197位糖基化位点,其余56株的糖基化位点未发现变化。抗原性分析结果显示:35株为疫苗组分BV株的类似株(35/58, 60.34%),23株为低反应株(23/58,39.66%)。结论:2021—2022流感监测季有3个进化分支的BV毒株在北京市人群中共同流行,其中Clade 1A.3a2毒株为优势株(93.10%),且与疫苗组分BV株进化距离有一定的偏离;占比近四成(39.66%)的毒株为疫苗低反应株。本研究结果提示,持续监测流感流行毒株的变异,及时为疫苗组分株筛选提供实验室依据,是应对流感大流行的基本技术保证。
乙型流感病毒、HA基因、基因变异、遗传进化分析、抗原性分析
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2024-01-30(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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