杭州地区7株重排乙型流感病毒基因组特征分析

摘要：

目的:研究杭州地区2014—2020年乙型流感流行情况并分析7株乙型流感病毒重排株遗传进化特征。方法:收集2014年1月—2020年12月杭州地区流感样病例16 943例，通过实时荧光定量PCR法检测乙型流感病毒，使用特异性引物扩增阳性样本的8个基因片段(
PB2、
PB1、
PA、
HA、
NP、
NA、
MP和
NS)进行纳米孔三代测序并分析其遗传进化特征。
结果:2014年1月—2020年12月杭州地区共鉴定了乙型流感病毒阳性样本1 090份，总阳性率6.43%(1 090/16 943)。其中乙型Yamagata支系474份，乙型Victoria支系616份。采用高通量测序获得乙型流感病毒全基因组228个，发现7株乙型流感病毒重排株，其中4株Yamagata系乙型流感病毒的
NA基因与Victoria系乙型流感病毒重排，2株Yamagata系乙型流感病毒(H644_BY和H648_BY)的
NP和
NA基因与Victoria系乙型流感病毒重排，1株Victoria系乙型流感病毒的
PB2、
PB1、
PA和
NS基因与Yamagata系乙型流感病毒重排，同时发现
HA和
NA基因存在多个抗原位点突变。
结论:2014—2020年杭州地区乙型流感病毒出现多株罕见重排株，具有潜在流行风险，需改进传统检测方法并密切关注乙型流感病毒的变异重排情况及其与疫苗株的匹配度。

关键词：乙型流感病毒、基因组、重排、遗传进化、神经氨酸酶

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资助基金：浙江省自然科学基金公益技术研究计划LGF19H190001;浙江省医药卫生科技计划2020KY237;浙江省卫生创新人才培养计划LGF19H190003;杭州市"卫生微生物"医学重点学科2020KY237;Zhejiang Province Public Welfare Technology Application Research Project;Zhejiang Province Medical Science and Technology Development Program;Zhejiang Provincial Program for the Cultivation of High-level Innovative Health Talents;Hangzhou Key Medicine Discipline Fund for Sanitary Microbiology

在线出版日期：2023-07-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：341-350