人正常宫颈上皮细胞感染沙眼衣原体的基因表达谱分析

摘要：

目的:分析人正常宫颈上皮细胞(HcerEpic)感染沙眼衣原体(
Chlamydia trachomatis, Ct)前后基因表达谱差异。
方法:HcerEpic细胞经DEAE-D预处理后加入E型
Ct标准株，培养44 h后收集HcerEpic细胞(感染组)，并以未感染
Ct的HcerEpic细胞作为对照组，提取两组总RNA后反转录并构建cDNA文库。通过高通量测序分析两组基因表达谱差异，并选择代表性基因通过实时荧光定量PCR(qPCR)验证。
结果:共检测23 997个基因，差异基因125个，其中上调基因119个，下调基因6个；GO分析显示差异基因富集于对病毒防御反应、Ⅰ型干扰素(interferon，IFN)信号通路、对Ⅰ型IFN的细胞反应等条目；KEGG富集通路为甲型流感、单纯疱疹病毒感染、EB病毒感染、HPV感染、NOD样受体通路等相关通路。结论:人正常宫颈上皮细胞感染
Ct前后转录组存在差异，差异基因主要富集于IFN通路，与细胞抗病毒过程密切相关。qPCR验证了ISG15、IFIT2、OASL、UBE2L6等差异显著且与IFN通路密切相关的基因。

关键词：沙眼衣原体、宫颈上皮细胞、转录组、差异表达基因

所属期刊栏目：43

资助基金：国家自然科学基金31700160;温州市科技局资助项目y20170011;National Natural Science Foundation of China31700160;Wenzhou Municipal Science and Technology Bureau Programy20170011

在线出版日期：2023-05-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：93-101