基于高通量测序技术的发热伴血小板减少综合征病毒全基因组多重PCR测序方法的建立与评价

摘要：

目的:基于二代测序(next generation sequencing，NGS)技术建立一种发热伴血小板减少综合征病毒(severe fever with thrombocytopenia syndrome virus, SFTSV)基因组的测序方法。方法:提取SFTSV阳性血清样本病毒核酸，利用Primer5.0软件设计SFTSV特异性引物，构建多重PCR方法对病毒核苷酸序列进行特异性扩增，利用二代测序仪进行全基因组测序。结果:28份SFTSV阳性血清样本均能进行特异性扩增并获得全序，覆盖度均超过94%, A型病毒株最多(20株)、其次为B型(4株)、E型(3株)。结论:本研究基于多重PCR建立了针对SFTSV的特异性强、质量好的高通量测序方法，提高了测序效率。

关键词：发热伴血小板减少综合征病毒、多重PCR、高通量测序、基因组

所属期刊栏目：42

资助基金：国家自然科学基金项目81773500;河南省青年人才托举工程项目2021HYTP049;河南省中青年卫生健康科技创新领军人才培养项目YXKG2020006;National Natural Science Foundation of China81773500;Henan Province Young Talent Support Project2021HYTP049;Henan Provincial Health Science and Technology Innovation Outstanding Young Talents Training ProjectYXKG2020006

在线出版日期：2023-05-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：931-939