2015—2019年南京市HIV-1 CRF07_BC毒株流行特征及分子进化分析

摘要：

目的:了解2015—2019年南京市HIV-1 CRF07_BC的流行史、进化模式和传播特征，为精准防控该毒株的传播提供科学依据。方法:对南京市319例HIV-1 CRF07_BC患者的
pol区基因序列扩增测序并构建最大似然树。使用MCMC(Markov Chain Monte Carlo)算法生成MCC树(Maximum Clade Credibility tree)，使用BSP(Bayesian Skyline Plot)法重塑有效人口规模数变化趋势。采用成对基因距离法构建分子网络探究其传播特征。
结果:319名HIV-1 CRF07_BC感染者中，95.0%为男性，多性伴(2个及以上)比例达82.8%，仅4.4%病例自报一直使用安全套，男男同性性行为(MSM)为最主要的感染途径(77.4%)。进化树结果显示，HIV-1 CRF07_BC呈现两大流行簇：Cluster1和Cluster2，Cluster1以MSM感染病例为主，Cluster2以异性性行为感染病例为主。Cluster1和Cluster2的最近共同祖先时间分别为2002.47(1999.91，2005.43)年、1996.38(1992.55，1999.76)年，进化速率(95% highest posterior density, 95%HPD)分别为1.73×10
-3 (1.36×10
-3 ~2.16×10
-3 )substitutions·site
-1 ·year
-1 、2.09×10
-3 (1.50×10
-3 ~2.79×10
-3 )substitutions·site
-1 ·year
-1，有效人口规模数分别在2002年、2003年之后趋于稳定。此外，Cluster1和Cluster2分别形成了11个、8个独特的分支，提示该基因型存在发散性流行的可能。分子传播网络中共形成35个传播簇，平均度数为4.3，92条南京分离序列分布在网络内。男性、MSM、多性伴有更大可能性入网，学生人群及年轻患者入网率较高。
结论:2015—2019年南京市HIV-1 CRF07_BC感染者存在低龄化现象，多性伴、无保护性行为及MSM突出。建议对学生、青年人群加以重点关注，对高危性行为制定更多有效的防控措施，并对CRF07_BC毒株进行持续的分子监测，为开展HIV CRF07_BC精准防控工作提供科学依据。

关键词：HIV-1 CRF07_BC、流行特征、分子进化

所属期刊栏目：42

资助基金：国家自然科学基金青年项目82103896;National Natural Science Foundation of China82103896

在线出版日期：2023-05-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：101-109