2021年河南省新型冠状病毒Delta变异株肺炎流行病学及分子特征研究

摘要：

目的:分析总结2021年河南省新型冠状病毒(severe acute respiratory syndrome coronavirus, SARS-CoV-2)Delta变异株肺炎流行病学及分子特征，为疫情防控提供依据。方法:依据中国疾病预防控制中心(Chinese Centre for Disease Control and Prevention, CDC)反馈测序结果，挑选2021年河南入境和本土病例为SARS-CoV-2 Delta变异株肺炎患者111例，从大疫情网上获得患者基本信息，对年龄、性别、是否接种疫苗、接种剂次、RT-qPCR检测
ORF1
ab基因和
N基因Ct值在不同性别及不同症状病例间有无差异、患者临床分型等进行统计学分析，对测序结果核苷酸及刺突蛋白(spike protein, S)突变位点进行分析，总结规律。
结果:111个病例在不同年龄组间的性别分布差异无统计学意义(χ
2＝2.217，
P＝0.529)。不同疫苗接种史人群中的病例类型差异无统计学意义(χ
2＝12.074，
P＝0.209)。SARS-CoV-2核酸阳性标本中，大部分标本Ct值分布在较低区间，病毒载量较高。
ORF1
ab基因Ct值在不同性别间的差异无统计学意义(χ
2＝1.646，
P＝0.439)，在无症状感染者、轻型、普通、重型之间差异具有统计学意义(χ
2＝13.257，
P＝0.039) 。
N基因Ct值在不同性别及不同症状病例间差异均无统计学意义(
P均>0. 05)。本研究的111例患者主要通过密接筛查和全员核酸筛查发现，两者共占总体的62.2%(69例)。测序长度覆盖度基本都大于99%(占90.1%，100/111)，核苷酸突变位点总数多为46~50个(86.4%，89/103)，S蛋白突变位点总数多为12个(82.5%，85/103)。103株Delta变异株均含有T19R、R158G、L452R、T478K、D614G、P681R、D950N、E156del、F157del这9个突变位点，突变率为100%。
结论:2021年河南省SARS-CoV-2 Delta变异株对人群普遍易感；病毒载量高，
ORF1
ab基因载量增高会加重临床症状。

关键词：新型冠状病毒、新型冠状病毒Delta变异株、S蛋白、ORF1 ab基因 、N基因

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资助基金：河南省省部共建重大专项SBGJ202001003;新型冠状病毒防控应急攻关首批项目201100310800;河南省中青年卫生健康科技创新领军人才培养项目YXKC2020006;Major Special Projects Jointly Established by the Provinces and Ministries of Henan ProvinceSBGJ202001003;The First Batch of Emergency Research Projects for the Prevention and Control of Novel Coronavirus201100310800;Henan Province Young and Middle-aged Health Technology Innovation Leading Talent Training ProjectYXKC2020006

在线出版日期：2023-05-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：11-15