2018年云南省6地州(市)手足口病病原检测及柯萨奇病毒A6型的基因特征分析

摘要：

目的 对2018年云南省6个地州(市)510份手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)病例粪便标本进行基因检测并对柯萨奇病毒A6型(Coxsackievirus A6,CV-A6)完整VP1区基因特征进行分析.方法 用病毒RNA提取试剂盒从粪便标本中直接提取病毒RNA,用MD91/OL68-1引物对病毒VP4区基因进行RT-PCR和测序,确定病毒型别,再用相关引物扩增肠道病毒VP1区全序并测序;按参考文献下载基因库中CV-A6病毒完整VP1区基因参考序列,用MEGA5.2软件计算不同毒株的核苷酸和氨基酸差异率,并构建系统进化树,进行基因特征和分子流行病学分析.结果 从510份标本中获得57份标本的VP4和VP1区基因,核酸检测阳性率为11.17％(57/510),其中CV-A643份,阳性率为8.43％(43/510),CV-A106份,阳性率为1.17％(6/510),EV-A712份,阳性率为0.39％(2/510),CV-A92份,阳性率为0.39％(2/510),另外检测到CV-A4、CV-A5、CV-B1和E11各1株,阳性率均为0.19％(1/510).基因进化分析表明,云南43株CV-A6均为基因型D的D3亚型.结论 510份标本中,CV-A6的检出率最高(8.43％),占阳性数的75.44％(43/57),CV-A10检出率为1.17％(6/510),EV-A71的检出率为0.39％(2/510),2018年云南省发生了以CV-A6为主的HFMD大暴发.基因特征分析表明,跟往年全国的情况一样,云南省2018年暴发的CV-A6为D3基因亚型.

关键词：手足口病、病原体、柯萨奇病毒A6型、VP4基因、VP1基因、基因特征分析

所属期刊栏目：39

分类号：R51;R54

在线出版日期：2020-01-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：885-891