31株深圳地区婴幼儿感染百日咳鲍特菌的流行特点、基因型、亲缘关系与大环内酯耐药性

摘要：

目的 通过分析百日咳感染患儿的临床信息和鉴定百日咳鲍特菌的基因型、耐药性和亲缘性,了解深圳地区百日咳鲍特菌的流行特点、基因组变异与大环内酯类耐药情况.方法 百日咳患儿的临床信息采集自深圳市儿童医院电子病历系统.我们对分离自患儿咽拭子的31株百日咳鲍特菌进行二代测序和基因组从头组装.通过序列比对鉴定多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)、毒力基因型与23S rRNA突变位点.通过构建系统进化树分析亲缘性.通过E-test鉴定临床分离株对大环内酯类抗生素的耐药性.结果 31株百日咳鲍特菌的MLST分型均为ST-2.毒力基因型呈多样性,其中2株为prn缺失型.基于进化树,深圳株与疫苗株亲缘关系远.19株百日咳鲍特菌为红霉素耐药,均携带23S rRNA编码基因的A2047G突变.结论 深圳地区百日咳鲍特菌的毒力基因型呈多样性,非疫苗株的基因型逐渐增多.大环内酯耐药株已有传播.本研究为改进百日咳的防治和疫苗策略提供了参考.

关键词：百日咳鲍特菌、二代测序、基因型、大环内酯耐药性

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资助基金：深圳市科创委基础研究项目JCYJ20160429181145972,JCYJ20170413094034978;深圳市卫计委临床研究课题SZLY2017016Shenzhen Science and Technology ProjectJCYJ20160429181145972,JCYJ20170413094034978;Health and Family Planning Commission of Shenzhen MunicipalitySZLY2017016

在线出版日期：2019-06-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：270-276