2017年深圳地区冬季诺如病毒基因分型与流行病学分析

摘要：

目的 对深圳地区2017年冬季诺如病毒(Norovirus,NoV)流行株基因型、流行病学特点及同源性进行分析和研究.方法 通过提取313份粪便样品的核酸后利用NoV特异性引物进行逆转录PCR(RT-PCR),将阳性PCR产物测序.根据样品测序序列及NoV参考株序列,利用软件Mega 4.1及Clustal W构建系统发生树.结果 NoV阳性样品共26份且均为GⅡ.4型,分别与GⅡ.4(KY407156)、GⅡ.4(KY580757)及GⅡ.4(KX372682)具有较高的同源性.此外,88.46％ 的NoV样品与本地区历年流行株同源性较低,且46.15％ 与我国其他地区流行株存在差异.结论2017年冬季深圳地区诺如病毒流行株以GⅡ.4型为主,且其在流行性及同源性上具有自身的特点,在当地公共卫生工作中需加强关注.

关键词：诺如病毒、基因型、系统发生树、同源性分析

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资助基金：中国医学科学院与健康科技创新工程协同创新团队项目2016-I2M-3-026;国家自然科学基金项目31700154;云南省重大科技专项生物医药2018ZF006;云南省科技计划项目2016FB034 Collaborative Innovation Team Project of Chinese Academy of Medical Sciences and Health Science and Technology Innovation Project2016-I2M-3-026;National Natural Science Foundation of China31700154;Major Science and Technology Project of Yunnan Province Biomedical Science 2018ZF006;Science and Technology Planning Project of Yunnan Province2016FB034

在线出版日期：2018-11-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：725-730