临床分离变形杆菌不典型第1类整合子结构分析

摘要：

目的 确定临床分离变形杆菌中不典型第1类整合子的结构.方法 在26株第1类整合酶基因阳性可变区扩增失败的变形杆菌临床分离株中,选取6株通过反向PCR扩增第1类整合酶基因周围DNA片段,PCR产物测序结果通过BLAST进行比对分析,确定同源目标序列后,查看GenBank该提取码对应序列文件靶序列周围序列,再根据周围序列设计合成引物进行重叠PCR并测序验证.结果 通过反向PCR及重叠PCR测序分析,26株变形杆菌临床分离株中,25株细菌第1类整合子可变区结构全部或部分确定,其中22株细菌第1类整合子可变区结构为estX-psp-aadA2-cm-lA1-aadA1a-qacI-tnpA-sul3,另3株第1类整合子可变区分别为estX-psp-aadA2-cmlA1、dfrA14、IS26,均缺失3′保守区.结论 反向PCR可用于临床菌株中不典型第1类整合子结构分析,在临床分离变形杆菌中首次检出基因盒 psp 及基因盒组合 estX-psp-aadA2-cmlA1-aadA1a-qacI-tnpA-sul3、 estX-psp-aadA2-cmlA1.

关键词：整合子、基因盒、反向PCR、耐药性、变形杆菌

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资助基金：浙江省自然科学基金LY15H190006;奉贤区社会类科技发展基金20151001;Natural Science Foundation of Zhejiang Province of ChinaLY15H190006;Fengxian District Society Science and Technology Development Fund Project20151001

在线出版日期：2018-08-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：440-445