EV68中国分离株 VP1基因高变区的特征分析

摘要：

目的：了解肠道病毒68（EV68）中国流行株 VP1基因序列的特征。方法通过Clustal W 法与多个国家 EV68的 VP1核酸序列进行比对，邻接法（Neighbor-Joining）构建系统进化树，与标准株 Fermon 相比，对该段区域编码的氨基酸序列进行分析。结果截至2015年底，中国已经分离出80株 EV68。在进化上，突变主要发生在 BC 和 DE 环中，中国分离株 VP1突变位置在83、89、91、94、96、97、98、102、109、139、141、142、143、144、147。并且大多数分离株 VP1编码的氨基酸序列在140位置发生缺失。由进化树可以得出位于 B、C 进化分支的中国分离株分别为53株和21株。结论与标准株 Fermon 相比，发现在 BC-loop 和 DE-loop 发生了很大变化，然而 BC-loop 和 DE-loop 这两个区域与病毒的抗原性和毒力有关。中国 EV68分离株位于 B 和 C 分支上。

关键词：EV68 病毒、VP1 基因、BC-loop、DE-loop、系统进化树

所属期刊栏目：36

分类号：S85;R39

资助基金：国家自然科学基金81373142Fund programNational Natural Science Foundation of China81373142

在线出版日期：2016-06-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：333-339