人类免疫缺陷病毒-1 CRF01 AE 毒株在我国的分子传播网络分析

摘要：

目的：构建我国 HIV-1 CRF01 AE 毒株分子传播网络，并分析网络特征。方法从洛斯阿拉莫斯国家实验室 HIV 基因数据库（Los Alamos database）下载中国地区的 CRF01 AE pol 区基因序列并进行人口学信息核对。通过构建系统进化树、提取传播簇、最小基因距离选择及传播网络可视化4个步骤构建传播网络。运用卡方检验分析不同人群参与网络形成的比例和网络中度的分布。描述性分析不同人群和不同地区之间的传播关联。结果2419条序列共形成250个大小介于2~25的传播网络，包括847个节点和610条边。度≥2的个体虽然只占网络中个体总数的26.4%（224/847），但与66.5%（563/847）的个体存在关联。男男同性性行为者（ MSM）、男性异性性行为者、静脉药瘾者（IDUs）及女性异性性行为者参与网络形成的比例分别为37.6%（669/1781）、28.4%（102/359）、16.1%（10/62）和30.4%（66/217），差异有统计学意义（χ2=23.774，P﹤0.001）。MSM 人群中度≥2的比例（10.8%，193/1781）显著高于男性异性性行为者（5.6%，20/359）和女性异性性行为者（4.6%，10/217）（P 值分别为0.002和0.004）。网络中绝大多数（95.5%，639/669）MSM 与其他MSM 之间存在传播关联，仅有2.4%（16/669）的个体与女性异性性行为者之间存在传播关联，但有15.1%（10/66）的女性异性性行为者与 MSM 之间存在传播关联。男性异性性行为者与女性异性性行为者之间存在传播关联的比例为35.3%（36/102），与 MSM 之间具有传播关联的比例为9.8%（10/102）。网络中20.9%（177/847）的个体与其他省份之间存在传播关联。结论较少比例的超级传播者在 CRF01 AE 毒株的分子传播网络形成中起到了核心作用，不同人群和不同地区之间的毒株进行着活跃的传播。

关键词：CRF01AE毒株、分子流行病学、传播网络、传播簇、系统进化分析

所属期刊栏目：36

分类号：R51;TQ4

资助基金：中央高校基本科研业务费专项资金及江苏省普通高校研究生科研创新计划项目KYLX150173；国家自然科学基金项目81273143；江苏省重点研发计划社会发展项目BE2015679；江苏省“六大人才高峰”第十一批高层次人才选拔培养资助项目2014-WSN-40Fund program Fundamental Research Funds for the Central Universities and Research Innovation Program for College Graduates of Jiangsu ProvinceKYLX150173；National Natural Science Foundation of China81273143；Key Research and Development Plan Social Developmentof Jiangsu Province BE2015679；The 11th High-level Talents Cultivation and Funded Project of“Six Talent Peak”of Jiangsu Province2014-WSN-40

在线出版日期：2016-06-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：321-327