10.3760/cma.j.issn.0254-5101.2015.10.008
2010—2012 年江苏省乙型流感病毒神经氨酸酶分子进化特征分析
目的 分析江苏省乙型流感病毒神经氨酸酶( NA)蛋白特征性氨基酸位点的变化,掌握江苏省乙型流感病毒NA分子进化特征. 方法 选择2010—2012年40株乙型流感毒株,两步法扩增NA基因片段,3730XL测序仪进行测序;利用DNAStar、Bioedit、MEGA5.0和BEAST 1.8.0等软件分析NA基因进化特征. 结果 从NA进化树可以看出,28株Victoria系的分离株NA来源于Yamagata系,发生了基因的重配;部分分离毒株在462位增加了一个糖基化位点;重要的酶活性位点及耐药位点氨基酸未发生变化;2010—2012 年江苏省乙型流感病毒NA基因核苷酸平均碱基替代率每年为1.74×10-3[95%HPD(最高后验密度区间):1.46×10-3 ~2.06×10-3]替换/位点;整体选择压力ω(ω=dN/dS)值为0.24. 结论 2010—2012年江苏省乙型流感病毒NA重要的氨基酸位点相对保守,基因速率缓慢,尚未受到明显的正向选择压力.
乙型流感病毒、神经氨酸酶、进化
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R37;R51
国家自然科学基金项目81273143;江苏省重点研发计划社会发展项目BE2015679;江苏省"六大人才高峰"第十一批高层次人才选拔培养资助项目2014-WSN-40
2016-01-04(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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