广东省2008-2013年柯萨奇 A6型肠道病毒的流行及其基因特征分析

摘要：

目的：了解柯萨奇A6型肠道病毒（ CVA6）在广东省的流行特点及其基因特征。方法对2008-2013年收集的手足口病非肠道病毒71型（ EV71）非CVA16肠道病毒阳性标本进行CVA6荧光定量PCR检测，选取 CVA6阳性标本进行 VP1全长序列扩增与测序，运用 DNAStar6．0和MEGA5．2软件对获取序列与从 GenBank 下载的 CVA6 VP1全长序列进行遗传进化分析。结果2008-2013年广东省手足口病非 EV71非 CVA16肠道病毒阳性标本中 CVA6占61．4％（1026/1672），每年分别占10．5％（4/38）、66．7％（34/51）、36．2％（81/224）、63．0％（182/289）、62．3％（325/522）和73．0％（400/548），CVA6在2008-2013年各年份非EV71非CVA16肠道病毒中的构成比差异有统计学意义（χ2＝133．79， P＜0．01）；CVA6在系统进化树中形成4个分支，各分支核苷酸差异为15．5％～23．1％，可分为A、B、C、D等4个基因群，D基因群可分为D1～D3等3个基因亚群；2008-2013年广东省CVA6流行株的核苷酸和氨基酸同源性分别为88．7％～100．0％和95．7％～100．0％，存在D2和D3亚群的流行，其中D2亚群流行于2008-2012年，D3亚群流行于2009-2013年。结论2008-2013年广东省手足口病非EV71非CVA16肠道病毒以CVA6为主。基于VP1序列分析，CVA6可分为A、B、C、D等4个基因群，D基因群的D2和D3亚群在广东省存在流行，其中D3亚群是优势流行株。

关键词：手足口病、柯萨奇A6型肠道病毒、基因群

分类号：R54;R37

资助基金：广东省医学科研基金项目B2014020

在线出版日期：2014-11-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：742-746