10.3760/cma.j.issn.0254-5101.2014.06.001
人冠状病毒 NL63中国株的全基因组克隆与序列分析
目的:对来自北京儿童医院的两份人冠状病毒NL63(human coronavirus NL63, HCoV-NL63)阳性样本进行病毒全基因组序列测定和分析。方法以荷兰株(NL63_Amsterdam 1)为参考株,设计18对包含重叠区域的、覆盖全长基因组的引物,采用病毒RNA提取、RT-PCR分段克隆测序的方法获得NL63国内株全长基因组序列;通过与其他毒株的比对分析,构建其系统发生树。结果NL63国内株基因组全长27538 bp,与参考株核苷酸相似性为99.1%,其中在1a区有连续15个碱基的缺失。系统发生分析表明,NL63目前可分为A型、B型、C型和D型共4个基因型,而国内株处在新的基因型( D型)。结论本研究首次获得了两株NL63国内分离株的全基因组序列,进一步阐明了基因组的结构特征,对其遗传进化作了系统分析,为国内NL63病毒的分子流行病学研究提供参考。
HCoV-NL63、全基因组测序、系统发生分析
R51;S85
国家重点基础研究发展计划973计划2011CB504704;科技重大专项十二五计划2013ZX10004601,2011 ZX10004-001
2014-07-23(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
共6页
411-416