10.3760/cma.j.issn.0254-5101.2014.04.004
2006-2011年青岛地区B型流感病毒全基因组进化特征分析
目的:了解2006-2011年间青岛地区流行的B型流感病毒的全基因组进化特征。方法选取2006-2011年间青岛地区分离的B型流感病毒,提取病毒RNA,应用逆转录聚合酶链反应( RT-PCR)扩增各基因片段,并进行序列测定;Sequencher 软件完成序列拼接。 MEGA5.0软件对各基因片段进行系统发育分析及分子特征分析。结果在血凝素( HA)基因进化树上,Victoria系V1分支为B/Malaysia/2506/2004样毒株,包含2006-2009年13个毒株,V2分支为B/Brisbane/60/2008样毒株,包含2009-2011年12个毒株;Yamagata 系全部为 B/Florida/4/2006样毒株, Y1分支包含2006-2008年5个毒株,Y2分支包含2010-2011年7个毒株。全基因组分析表明V2分支3个毒株发生了5+3重配,1个毒株发生了1+7重配,重配株均与前一季及当季疫苗株同亚型;HA进化树上处于Yamagata系的毒株全部属于基因型2,处于Victoria系的毒株全部属于基因型15;HA1蛋白与疫苗株进行比较:Victoria系分离株主要变异位点包括H14Q、L58P、N129S、I146V、N171D、R279K;Yamaga-ta系分离株主要变异位点包括R48K、K88R、P108A、N116K、S150I、N165Y、D196N、N202S、S229G;位点116和129、位点150、位点165、位点196和202分处以往证实经历阳性选择的抗原表位120环、150环、160环和190环。结论2006-2011年青岛地区B型流感病毒两系共流行,并且持续进化;疫苗的使用可为同系病毒造成选择压力,而双组分的B型流感疫苗可能更为有效。
流感病毒B型、全基因组、抗原变异、进化
R39;R37
青岛市公共领域科技支撑计划项目10-3-3-8-1-nsh
2014-06-18(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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