10.3760/cma.j.issn.0254-5101.2014.03.002
隐匿性乙型肝炎病毒感染者病毒S基因的适应性进化分析
目的:检测隐匿性乙型肝炎病毒( HBV )感染者病毒S基因的适应性进化现象,验证隐匿性HBV感染现象的分子机制。方法 GenBank中下载隐匿性HBV感染者病毒S基因及HBV各基因型参考株序列,PAML4.07软件检测其阳性选择位点。结果 Clustal W对位排列、手工比对后共获得174条隐匿性HBV感染者病毒S基因。 PAML4.07软件包CODEML程序中,LRT法检验分析结果显示选择模型均显著优于中性模型,优化模型M8( BEB法)共检出14个阳性选择位点,其中有8个位点位于外膜蛋白免疫表位区。 HBV各基因型参考株S基因仅检出2个阳性选择位点。结论隐匿性HBV感染者病毒S基因在宿主强烈免疫抑制下发生适应性进化形成免疫逃避株,故病毒能持续存在。
乙型肝炎病毒、隐匿性感染、适应性进化
R37;R5
国家传染病防治科技重大专项2012ZX10004907;国家自然科学基金81072354,81202258,81370082
2014-05-21(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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