深圳市腹泻患者星状病毒感染的分子流行病学特征

摘要：

目的 了解深圳地区感染性腹泻中星状病毒的感染情况,并研究其分子流行病学特点.方法 采集深圳市2010年1月至2011年12月2083例疑似腹泻患者粪便标本,同时采集30例健康人粪便标本作为对照,采用荧光RT-PCR检测星状病毒核酸；然后使用特异性引物,对星状病毒核酸阳性标本进一步采用RT-PCR方法扩增星状病毒的ORF2区域,对PCR扩增产物经纯化、测序后进行序列分析,同时对病例的流行病学资料进行统计分析.结果 星状病毒检出率为1.39％ (29/2083)；其中6月龄以下、6～11月龄、12 ～ 35月龄和36月龄以上患者检出率分别为2.96％ (5/169)、1.48％ (8/707)、2.48％(3/121)和1.20％(13/1086)；星状病毒在冬季检出率较高,春季次之,夏季和秋季则较少发生.对ORF2区域进行基因测序和分析显示,深圳地区星状病毒以HAstV-1为主要流行株,HAstV-2、HAstV-5亦有检出,其他型别则未检出.其中HAstV-1又可分为3个亚组,分别与GenBank上的德国株(AY720892)、印度株(AB551380)和巴西株(AY846638)有较高的亲缘关系,其核苷酸同源性分别为98.3％ ～99.1％、96.0％ ～ 100％和98.0％ ～ 100％.结论 星状病毒是深圳地区病毒性腹泻的重要病原之一,HAstV-1是深圳地区星状病毒的主要流行株,应加强对星状病毒腹泻的监测.

关键词：星状病毒、分子流行病学、基因进化分析

所属期刊栏目：33

分类号：R378;R512.5;R725.1

资助基金：深圳市科技计划;深圳市宝安区科技创新局项目

在线出版日期：2013-06-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：276-280