引起河南省一起病毒性脑炎暴发的柯萨奇病毒B5的鉴定及其序列分析

摘要：

目的 鉴定2011年引起河南省漯河地区一起病毒性脑炎(VE)暴发的病原体,并对分离的柯萨奇病毒B5(CVB5)进行基因特征分析.方法 采集漯河地区病毒性脑炎暴发期间29例患者的5份咽拭子、21份粪便和14份脑脊液,采用实时荧光RT-PCR方法分别检测总肠道病毒(PE)、EV71及CA16病毒核酸.所有标本均进行病毒分离培养,对其中5例患者的2份粪便和3份脑脊液的阳性分离产物进行VP1和5′-UTR区核苷酸序列测定及亲缘进化分析.结果 实时荧光RT-PCR结果显示,所有临床标本EV71和CA16病毒核酸检测均为阴性,咽拭子、粪便和脑脊液的PE核酸检测阳性率分别为60.0％(3/5)、61.9％(13/21)和85.7％ (12/14).咽拭子、粪便和脑脊液病毒分离率分别为20.0％(1/5)、25.0％(5/21)和29.0％ (4/14).VP1和5′-UTR区核苷酸序列BLAST分析及分子分型结果显示为CVB5,对其中5株分离毒株进行VP1全长基因分析显示彼此之间核苷酸同源性为97.9％ ～ 99.5％.与其同源性最近的毒株是2010年引起长春手足口病暴发的CVB5分离株CC10/10/Changchun,核苷酸同源性为97.1％～98.1％.与2010及2012年河南省平顶山地区的脑炎分离株COXB5/Henan/2010和03001N/HN/CHN/2011/CB5的同源性分别为89.0％～89.6％和91.8％～92.5％.VP1区遗传进化树显示此次分离株为基因型D,且与长春株成一簇.结论 导致此次病毒性脑炎暴发的病原体为肠道病毒CVB5,优势基因型的变迁可能与此次暴发相关.

关键词：病毒性脑炎、柯萨奇病毒B5、遗传进化分析

所属期刊栏目：32

分类号：S852.65;R373.2;R5

资助基金：河南省医学科技攻关计划;河南省医学科技攻关计划省部共建项目

在线出版日期：2013-01-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：610-613