我国新分离盖塔病毒的部分基因组分子特征研究

摘要：

目的 通过分子生物学方法研究我国山东省2008年分离的盖塔病毒(DY0824)基因组分子生物学特征.方法 应用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)扩增出结构区基因和3' UTR片段,连接到载体中进行序列测定,然后用Clustal X1.83和MegaAlign软件对测定的核苷酸和推测的氨基酸序列进行比较分析,用Mega4软件绘制系统发生树.结果 DY0824病毒株衣壳蛋白由804个核苷酸组成,编码268个氨基酸,与国内外其他分离株的核苷酸同源性为95.4%～99.9%,氨基酸同源性为97.4%～100%.E2蛋白全长1266个核苷酸,编码422个氨基酸,与其他株的核苷酸同源性为94.8%～99.5%,氨基酸同源性为97.6%～100%.该病毒3' UTR由401个核苷酸组成,存在3个重复序列.结论 山东省新分离盖塔病毒衣壳蛋白和E蛋白基国与该病毒原型分离株相比分别存在7个和10个氨基酸差异位点,病毒3'UTR区域存在多个核苷酸差异位点.

关键词：盖塔病毒、衣壳蛋白基因、E2蛋白基因、3’非翻译区、核苷酸序列

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分类号：R3(基础医学)

资助基金：国家科技部重大传染病专项2003BA12A08-01;艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治重大专项项目20087ZX10004-010

在线出版日期：2010-06-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：399-404