两种型特异性引物聚合酶链反应法检测乙型肝炎病毒基因型和亚型的评价

摘要：

目的 比较并评价本室创建的方法和日本Naito 等建立的乙型肝炎病毒(HBV)型特异性引物聚合酶链反应(PCR)基因分型法.方法 分别用新方法和Naito法检测系列稀释的含有A、D基因型和B1、C2亚型HBV基因组的质粒及不同浓度比例的B1/C2亚型混合质粒,评价两种方法的灵敏度和特异度.此外,用该两种方法分别对深圳市、河北邯郸市、新疆乌鲁木齐市送检的113份HBV DNA阳性慢性乙型肝炎患者的血清标本进行HBV基因分型,并对该两种分型方法检测结果不一致的血清样本,用PCR产物直接测序法分析.结果 两种方法对单一型别的质粒样本灵敏度无差异,但新方法对B/C混合型质粒样本的灵敏度及对各型别质粒样本的特异度明显优于Naito法.该两种方法检测单一基因型血清标本的灵敏度无差异,但新方法对B/C混合型血清样本的检出率更高.该两种方法检测结果总符合率为83.2%(94/113),不一致率为16.8%(19/113).从两法分型不一致的19份血清标本中,选取15份以PCR产物直接测序法进行分析,结果与新方法检测结果完全一致,而与Naito法不一致.结论 本室建立的HBV型特异性引物-PCR基因分犁法具有较高灵敏度,其特异度也明显优于目前临床上常用的Naito法,适用于HBV 基因型和基因亚型的临床及流行病学研究.

关键词：乙型肝炎病毒(HBV)、基因型、基因亚型、型特异性引物聚合酶链反应

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分类号：R3(基础医学)

资助基金：国家攻关课题2008ZX10201;国家重点基础研究发展规划973计划2005CB523104

在线出版日期：2010-01-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：1042-1048