寡核苷酸基因芯片方法检测干燥综合征患者信号转导及细胞因子相关基因的表达

摘要：

目的 应用寡核苷酸全基因芯片方法分析干燥综合征患者及正常对照者外周血单个核细胞(PBMC)的信号转导及细胞因子相关差异表达基因,分析此类差异表达基因的生物学意义,为探讨疾病的发病机制、诊断及治疗提供新的依据.方法 取3例初发原发性干燥综合征患者及3例同年龄正常对照者的PBMC,提取总RNA,反转录并进行体外扩增,分别用Cy3及Cy5荧光标记干燥综合征组及对照组cDNA样品,与寡核苷酸芯片进行杂交.采用LuxScan 3.0图像分析软件对芯片图像进行数据提取,以Cy5/Cy3的比值数据进行分析(SAM软件),寻找差异表达基因,并对差异表达基因用分子功能注释(MAS系统)进行处理,分析其生物学含义.结果 干燥综合征组与对照组PBMC细胞因子及信号转导相关的差异表达基因中以趋化因子及细胞因子受体通路[FASLG(Fas ligand)、CCL5、CCR3、IL-4R、CXCLIO(CXC chemokine ligand 10)、TNFRSF19L(tumor necrosis factor superfamily 19 ligand)、CX3CR1(CX3C chemokine receptor 1)],黏附分子信号通路[细胞间黏附分子-1(ICAM1)],Jak-STAT信号通路[STAT4(signal transducer and activation of transcription 4)、CISH(chromogenic in situ hybridization)、IL-4R],Toll样受体信号通路(CCL5、CXCL10)中的基因差异最为显著(P<0.05).以上疾病通路中上调表达基因有4个,下调表达基因有6个.结论 干燥综合征患者在信号转导及细胞因子相关疾病通路基因有异常表达,这些基因表达数据将为研究疾病的发病机制及今后的诊断治疗提供重要依据.

关键词：干燥综合征、基因芯片、表达谱分析、外周血单个核细胞、信号转导

所属期刊栏目：29

分类号：R5(内科学)

在线出版日期：2009-04-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：186-190